La  consolle dell'operatore controlla tutte le funzioni dello spettrometro. La progettazione e l'implementazione degli esperimenti e l'analisi dei dati sono controllate dai comandi digitati dall'operatore sulla consolle. Le sottounità della consolle dell'operatore sono le seguenti:

 Computer Host: si tratta di un Personal Computer. Il computer host esegue il programma TopSpin e gestisce le analisi e l'archiviazione dei dati. Tutte le operazioni importanti per l'acquisizione dei dati sono controllate da un secondo sistema di elaborazione chiamato AQS sito all'interno della consolle stessa.

 Connessione Ethernet dal computer host all'AQS: utilizzata per trasferire dati e istruzioni tra il computer host e l'AQS.