L'effetto dell' accoppiamento spin-spin possono essere rimossi con una tecnica detta "disaccoppiamento". L'effetto del disaccoppiamento è quello di mascherare la presenza di un particolare gruppo protonico, ad esempio i protoni H_e nella figura dell'etilbenzene. Si acquisisce uno spettro come se i protoni H_e fossero assenti. Questo si ottiene trasmettendo una sequenza di impulsi di disaccoppiamento alla frequenza di risonanza f_e dei protoni H_e, quindi modificando in modo permanente l'orientazione di spin di questi protoni. Per lo spettro illustrato nella figura dello spettro dell'etilbenzene la frequenza di disaccoppiamento sarebbe 1,25 ppm sopra il picco del TMS.

 Gli impulsi di disaccoppiamento tendono a essere più lunghi e di potenza inferiore rispetto agli impulsi di eccitazione. La figura che segue è una rappresentazione di un esperimento di disaccoppiamento, mentre la figura dello spettro dell'etilbenzene con disaccoppiamento omonucleare mostra lo spettro disaccoppiato. Il quartetto CH₂ ora è diventato un  singoletto. Gli spettroscopisti dicono che il quartetto è collassato in un singoletto. Inoltre, l'area sottostante il singoletto deve essere uguale a quella del quartetto originale (confrontare le altezze relative dei picchi del CH₂ e dell'anello benzenico nelle due figure). Il segnale relativo al gruppo CH₃ a 1,25 ppm non compare nello spettro disaccoppiato, in quanto gli impulsi di disaccoppiamento eliminano proprio gli effetti della presenza dei protoni CH₃.

L'esperimento appena descritto è un esempio di disaccoppiamento omonucleare in quanto lo stesso isotopo, ¹H in questo caso, è osservato e disaccoppiato.  Si parla di disaccoppiamento eteronucleare quando l'isotopo osservato è diverso da quello disaccoppiato. Nel capitolo Spettro¹³C con disaccoppiamento protonico di questo manuale si eseguirà un esperimento di disaccoppiamento eteronucleare dove si osserva ¹³C e si disaccoppia ¹H. Gli spettrometri AVANCE sono in grado di eseguire tipi di esperimenti molto complicati a seconda del numero di canali installati. Uno spettrometro a quattro canali può essere utilizzato per osservare un nucleo e disaccoppiarne altri tre. Avendo fino a otto canali indipendenti, il ventaglio dei possibili esperimenti si apre a dismisura. L'utente deve sapere che attualmente il fattore limitante non è la generazione degli impulsi di radiofrequenza per eccitare e disaccoppiare, ma è il trasferimento di questi impulsi al campione attraverso le sonde e in una certa misura attraverso i preamplificatori. Il routing del segnale dell'esperimento da eseguire viene impostato utilizzando il menu "edasp". Per ulteriori dettagli, consultare il manuale "Comandi e parametri di acquisizione" (P/N H9775SA3).