Il  magnete genera il campo magnetico necessario per indurre le transizioni NMR. Per mantenere un sistema superconduttore, la bobina del magnete viene raffreddata a temperature molto basse usando azoto ed elio liquidi (per maggiori dettagli vedere il paragrafo Magnete e contenitore Dewar del magnete).

Il  sistema di shim a temperatura ambiente, montato sull'estremità inferiore del magnete, è un insieme di bobine di trasporto della corrente (note come shim) utilizzate per massimizzare l'omogeneità del campo compensando eventuali disomogeneità presenti. Le correnti in queste shim a temperatura ambiente (così chiamate perché non vengono raffreddate mediante immersione in un bagno di elio liquido) sono controllate dal BSMS e possono essere modificate dal display del BSMS  per ottimizzare il segnale NMR. Ciò ha un effetto importante sulla risoluzione e la sensibilità del segnale. Questa azione di regolazione delle correnti nelle shim a temperatura ambiente viene definita  shimming del magnete.

 

Anche se l' HPPR/2 (Preamplificatore ad alte prestazioni) trasporta il segnale trasmesso al campione, la sua funzione primaria è quella di amplificare i segnali relativamente deboli emessi dal campione. È situato alla base del magnete per amplificare il segnale NMR alla prima opportunità e così ridurre al minimo le perdite lungo il cavo. Una volta che il segnale è stato amplificato con l'HPPR/2, eventuali perdite successive lungo il cablaggio sono meno critiche. L'HPPR/2, inoltre, trasmette e riceve i segnali di lock del deuterio (o fluoro) e viene utilizzato nella routine di oscillazione. È possibile configurare fino a 8 ( HPPR/2) moduli individuali (escluso il modulo di copertura che è sempre presente). Una configurazione molto comune è composta da tre moduli individuali: protone, X-BB e 2H oltre al modulo di copertura.

La sonda è inserita nel sistema di shim alla base del magnete ed è composta essenzialmente da varie bobine utilizzate per trasmettere gli impulsi di eccitazione al campione e per ricevere il segnale emesso. La sonda trasmette e riceve anche il segnale di lock.